Tai turėtų būti institucija, atskaitinga nebe Vyriausybei, o Švietimo ir mokslo ministerijai. Ji taptų Valstybiniu studijų fondu. Taip siekiama sustiprinti atsakomybę už valstybės politikos studijų srityje įgyvendinimą, centralizuoti mokslui skirtų lėšų valdymą ir panaikinti su mokslo bei technologijų programomis susijusių funkcijų dubliavimą. Valstybiniam studijų fondui būtų pavesta administruoti naujas finansavimo priemones studentams.
Pritarta ir kitam Saulėlydžio komisijos siūlymui – Mokslo tarybai perduoti Valstybinio mokslo ir studijų fondo paramos teikimo moksliniams tyrimams ir eksperimentinei plėtrai bei kitas su mokslu susijusias funkcijas ir vykdytas programas. Mokslo taryba taip pat vykdys Tarptautinių mokslo ir technologijų plėtros programų agentūros funkciją.
Saulėlydžio komisija taip pat siūlo Tarptautinių mokslo ir technologijų plėtros programų agentūros pagrindu steigti Inovacijų agentūrą.
