Vilniaus miesto klinikinė ligoninė yra respublikinio lygmens, teikianti įvairių profilių paslaugas – vidaus ligų, akušerijos-ginekologijos, chirurgijos ir kt. Ligoninė gerai aprūpinta kokybiška diagnostine-gydomąja medicinine įranga. Taigi, atlikus reorganizaciją, klinikinės ligoninės teikiamų paslaugų spektras būtų papildytas psichikos sveikatos priežiūros paslaugomis. Kai kurios teikiamos psichikos sveikatos priežiūros paslaugos yra unikalios ir šiuo metu neturi analogų Lietuvoje – tai Valgymo sutrikimų, Krizių intervencijos, taip pat gerai išvystytas Dienos stacionaro, Psichoterapijos stacionaro paslaugų bei ambulatorinių konsultacijų teikimas. Planuojama, kad po reorganizacijos Vilniaus miesto psichikos sveikatos centras veiks kaip Vilniaus Antakalnio klinikinės ligoninės filialas.
Dar 2003 metais nepriklausomi konsultantai atliko stacionarių sveikatos priežiūros įstaigų galimybių studiją. Atsižvelgiant į ją, tuometinė miesto Taryba 2004 metais pritarė Vilniaus miesto savivaldybės stacionarių asmens sveikatos priežiūros įstaigų pertvarkymo planui, kuriame buvo numatyta Vilniaus miesto psichikos sveikatos centrą prijungti prie viešosios įstaigos Vilniaus miesto universitetinės ligoninės ir Vilniaus universitetinės Antakalnio ligoninės (dabar – Vilniaus miesto klinikinė ligoninė).