Kaip pranešė muziejus, labiausiai laukiami svečiai yra muziejaus bendraamžiai dešimtmečiai vaikai, kuriems prezidentūros istorikai ves Lietuvos piliečio pamokas. Tokios pamokos pasiklausyti į muziejų atvyks ir Kauno lopšelio-darželio „Spragtukas“ vaikai.
Istorinė prezidentūra lankytojams duris atvėrė 2005 metų liepos 5 dieną. Idėja apie galimą muziejaus įkūrimą istorinėje vietoje kilo apie 1990 metus, kai tarpukariu buvęs valstybės prezidento rezidencijos pastatas, sovietmečiu pavirtęs Pionierių rūmais, o vėliau Mokytojų namais, buvo perduotas Vytauto Didžiojo karo muziejui.
Po užsitęsusių rekonstrukcijos darbų, simbolinis buvusių prezidento rūmų (Vytauto Didžiojo karo muziejaus padalinio) atidarymas įvyko 2003 metų vasario 16 dieną, minint 85-ąsias Lietuvos valstybės atkūrimo metines. Nuo 2004 metų šie rūmai pateko Lietuvos Prezidentūros kanceliarijos žinion.
2005 metų liepos 3 dieną tuometinis Lietuvos prezidentas Valdas Adamkus oficialiai perdavė istorinius prezidentūros rūmus Kaune Nacionaliniam M. K. Čiurlionio dailės muziejui.
Per metus muziejuje vidutiniškai apsilanko apie 12 tūkst. lankytojų. Per dešimt veiklos metų muziejuje surengta per 300 įvairių kultūrinių pažintinių renginių, muziejaus sodelyje pristatytos devynios archyvinių fotografijų parodos apie tarpukario Kauną, atidaryta 20 trumpalaikių ir ilgalaikių parodų muziejaus salėse.
