Minsko teigimu, „universitetas vykdo kryptingą darbą siekdamas destabilizuoti socialinę ir politinę padėtį šalyje“, taip pat jį „naudoja kai kurių kaimyninių valstybių specialiosios tarnybos, siekdamos pakenkti Baltarusijos interesams politinėje, humanitarinėje ir informacinėje sferose“.
EHU buvo įkurtas Minske 1992 metais, tačiau jau 2004-aisiais dėl politinių priežasčių jo veikla Baltarusijoje nutraukta.
Sulaukęs pagalbos iš Lietuvos Vyriausybės, Europos Komisijos, Šiaurės Ministrų Tarybos, Jungtinių Amerikos Valstijų ir kai kurių Europos valstybių, universitetas atnaujino savo veiklą Vilniuje.
Universitetui 2006 metais išduotas leidimas vykdyti studijas ir su jomis susijusią veiklą Lietuvoje.
Pasak „Nasha Niva“, EHU studijuoja apie 1,5 tūkst. studentų ir dirba apie 100 dėstytojų.
Rugpjūtį EHU socialinių tinklų paskyros Minsko buvo pripažintos „ekstremistine medžiaga“.
