PPO arbitrais gali būti skiriami vyriausybių atstovai ar nepriklausomi tarptautinės prekybos teisės ekspertai, atsižvelgiant į jų kompetenciją, PPO susitarimų ir organizacijos veiklos išmanymą, akademinę veiklą.
PPO sprendžia ginčus tarp vyriausybių dėl PPO susitarimų ar šalių prisiimtų specifinių įsipareigojimų įgyvendinimo. Paprastai tokį ginčą nagrinėja 3 arbitrų kolegija, parinkta sutarus abiems ginčo šalims arba paskirta PPO generalinio direktoriaus.
Šiuo metu veikiantis PPO ginčų sprendimų mechanizmas yra vienas efektyviausių tarptautinės teisės ginčų sprendimų mechanizmų pasaulyje, nuo 1995 m. paskelbęs daugiau kaip 300 raportų.
