Atnaujinant programą ypatingas dėmesys buvo skiriamas Valstybės kontrolės valstybinio audito ataskaitoje dėl 2002-2007 m. Nacionalinės kovos su korupcija programos pateiktoms rekomendacijoms, Seimo Antikorupcijos komisijos ir Seimo Audito komiteto pasiūlymams.
NKKP projektas buvo kruopščiai derinamas su valstybės ir savivaldybių bei viešosiomis įstaigomis, visuomeninėmis organizacijomis. Programos projektas buvo patalpintas Specialiųjų tyrimų tarnybos (STT) interneto tinklalapyje ir buvo viešai prieinamas kiekvienam norinčiam išsakyti pastabas ir pateikti pasiūlymus dėl atnaujinamos NKKP.
Kaip ir anksčiau galiojusią NKKP, naujosios programą priemonių planą sudaro trys blokai: korupcinio pobūdžio teisės pažeidimų tyrimai, korupcijos prevencija ir antikorupcinis švietimas. Tačiau, lyginant su ankstesne NKKP, naujoje programoje aiškiai apibrėžta korupcijos samprata, numatyti konkretūs programos tikslai ir uždaviniai.
Taip pat pasikeitė programos valdymo schema: sustiprintas Tarpžinybinės komisijos kovai su korupcija koordinuoti ir STT vaidmuo vykdant programos įgyvendinimo kontrolę, nustatyta aiški valstybės ir savivaldybių įstaigų pasiūlymų ir ataskaitų teikimo bei informacijos pateikimo tvarka. Naujai pažvelgta į NKKP priemonių plano struktūrą ir turinį. Uždavinių įgyvendinimui suformuluotos konkrečios priemonės bei numatyti konkretūs priemonių įgyvendinimo vertinimo kriterijai. Programos rengėjų nuomone, tai palengvins nuolatinės stebėsenos vykdymą ir objektyvų grįžtamąjį ryšį.
Naujoje programoje daugiausiai priemonių yra skirta korupcijos prevencijai, siekiant administracinių ir viešųjų paslaugų gerinimo, elektroninės valdžios, muitų, sveikatos priežiūros, statybų, aplinkos valdymo, Europos Sąjungos struktūrinės paramos, viešųjų pirkimų srityse.
NKKP įgyvendinimui nėra numatytas atskiras finansavimas, Programa bus įgyvendinama iš valstybės ir savivaldybių įstaigoms skiriamų lėšų.
