Šią viešąją įstaigą kaip dalininkės valdo Socialinės apsaugos ir darbo bei Švietimo ir mokslo ministerijos, kurioms vadovauja „darbiečių“ ministrai Algimanta Pabedinskienė ir Dainius Pavalkis.
Prie ministerijų vairo stojus „darbiečiams“, į ESFA valdybą buvo pasiųsti vien politinio pasitikėjimo pareigūnai – Darbo partijos atstovai. Taip pat buvo parengti ESFA įstatų pakeitimai, pagal kuriuos nebe direktorius, o valdyba spręstų kai kuriuos jau įgyvendinamų projektų reikalus.
Be to, liepos pradžioje valdybai buvo pateiktas siūlymas agentūroje įsteigti papildomą direktoriaus pavaduotojo pareigybę, taip pat naują direktoriaus patarėjo bendravimui su valdyba etatą. Dabar agentūros vadovas turi tris pavaduotojus. Pagal pasiūlytą planą, naujasis direktoriaus pavaduotojas perimtų kai kurias dabartines ESFA vadovo kompetencijos sritis.
Tokioms pertvarkoms pasipriešino du agentūros valdybos nariai – vidaus reikalų viceministras „tvarkietis“ Algimantas Juocevičius ir Finansų ministerijos ES struktūrinės paramos valdymo departamento direktorė Loreta Maskaliovienė.
„Nebuvo jokių argumentų, kodėl reikia pakeitimų, tad tokiems siūlymams negalėjome pritarti“, – „Lietuvos rytui“ patvirtino L. Maskaliovienė.
Pasak dienraščio, atrodo, kad taip „darbiečiai“ tiesiog pamėgino izoliuoti dabartinį ESFA direktorių Povilą Česonį.
ESFA šuo metu administruoja apie 3,2 mlrd. litų iš Žmogiškųjų išteklių plėtros veiksmų programos 2007–2013 metų finansinėje perspektyvoje. 2014–2020 metų ES paramos laikotarpiu ESFA administruos iki 4 mlrd. litų projektams.
