G.Kirkilo Vyriausybės pateiktame 2009 m. biudžeto projekte Ūkio ministerijai buvo numatyta 1 mlrd. 116 mln. litų asignavimų išlaidų, rašoma Vyriausybės pranešime spaudai. Tuo tarpu A.Kubiliaus Vyriausybės patobulintame ir Seimo patvirtintame 2009 m. biudžete Ūkio ministerijai numatyta (įskaitant asignavimus steigiamai Energetikos ministerijai) 1 mlrd. 41 mln. litų asignavimų. Todėl Energetikos ministerijos įkūrimui ir jos veiklai finansuoti iš valstybės biudžeto papildomų lėšų nebus skiriama. Energetikos ministerijai nebus skiriama ir papildomų valstybės tarnybos etatų. Ministerija bus kuriama atitinkamai sumažinant Ūkio ministerijos etatus.
„Tiek visas energetikos sektorius, tiek atskiros didžiosios energetikos bendrovės, kurių akcininkė yra valstybė, reikalauja žymiai geresnio valdymo nei iki šiol. Ankstesnės Vyriausybės vadovaujama Ūkio ministerija iki šiol neefektyviai gynė visuomenės interesus, ypač mažesnių elektros energijos kainų vartotojams poreikį. Energetikos ministerijos įkūrimas leis efektyviau reguliuoti energetikos sektoriaus monopolistus ir taip ne tik papildomai nekainuos, bet dar padės sutaupyti milijonus mokesčių mokėtojų lėšų“, – teigė ministras pirmininkas Andrius Kubilius.
Pasak premjero, per artimiausius metus kylantys dideli iššūkiai energetikos srityje iš valstybės reikalauja efektyvaus institucinio mechanizmo jiems spręsti. Todėl Energetikos ministerijos įkūrimas leis pradėti spartaus ir didelės apimties daugiabučių gyvenamųjų namų atnaujinimo (šiltinimo) programą, užtikrinti žymiai greitesnį strateginių energetikos projektų (naujos atominės elektrinės, elektros tiltų į Lenkiją ir Švediją, įsijungimo į UCTE sistemą) įgyvendinimą.
Per artimiausius metus taip pat numatyta pasirengti strateginių gamtinių dujų infrastruktūros projektų realizavimui – dujotiekio į Lenkiją tiesimui bei suskystintų dujų terminalo statybai.