J.Baušys rašė politikos, kultūros temomis. Su V.Puplauskiu sukūrė scenarijus TV dokumentiniams filmams „Vilnius. Prieš aušrą“, „Pastabos žemėlapių pakraščiuose“, „Pasiilgom arklio“, „Iš gerumo abėcėlės“, „Kaunas yra Kaunas“, „Žemei ir žmogui“, su G.Skvarnavičiumi – Lietuvos kino studijos dokumentiniam filmui „Reik drąsos prie mėsos“.
Iš vokiečių kalbos išvertė Egono Ervino Kišo knygą „Pašėlęs reporteris“.
