2008 m. Sveikatos apsaugos ministerijos ir jai pavaldžių viešojo administravimo įstaigų sąrašuose buvo 2106 pareigybės. Vykdant sveikatos apsaugos valdymo sistemos pertvarką kaip juridinis asmuo buvo likviduoti Farmacijos departamentas, Valstybinė medicininio audito inspekcija ir Valstybinė visuomenės priežiūros tarnyba. Dalį šių reorganizuotų įstaigų funkcijų perėmė Sveikatos apsaugos ministerija. Todėl kai kurie likviduotų įstaigų darbuotojai pradėjo dirbti ministerijoje, kiti buvo atleisti.
Atlikus šiuos pertvarkymus buvo optimizuotas valdymas ir sumažintos valdymo ir administravimo funkcijoms užtikrinti skirtos išlaidos. Pabrėžtina, kad lyginant 2008 m. su 2012 m. SAM ir jai pavaldžiose viešojo administravimo įstaigose yra 231 pareigybe mažiau.
