Klaipėdos apskrities VMI pripažino netekusiu galios savo 2003-03-17 sprendimą „Dėl AB „Laivitė“ atleidimo nuo 382 393 Lt fizinių asmenų pajamų mokesčio (FAPM) delspinigių, apskaičiuotų nuo 1998-04-01 iki 2001-08-31“, nes AB „Laivitė“ nevykdė investicijų projekto pagal pateiktą grafiką. Valstybinė mokesčių inspekcija šį Klaipėdos AVMI sprendimą patvirtino, o Mokestinių ginčų komisija prie LR Vyriausybės įmonės skundą paliko nenagrinėtą. AB „Laivitė“ kreipėsi į Vilniaus apygardos administracinį teismą, prašydama panaikinti šiuos sprendimus kaip neteisėtus ir nepagrįstus. Bendrovės atstovai pažymėjo, kad siekė ir siekia vykdyti prisiimtus įsipareigojimus, tačiau negalėjo numatyti, kad gerokai pasikeis aplinkybės, kurios riboja bendrovės galimybes gauti ir atlikti daugiau laivų remonto užsakymų, trūksta kvalifikuotos darbo jėgos, teigiama išplatintame pranešime spaudai.
Valstybinė mokesčių inspekcija mano, kad skundo argumentai yra teisiškai nereikšmingi ir neturi įtakos skundžiamų sprendimų teisėtumui, jie yra pagrįsti ir teisingi, priimti išsamiai ir objektyviai išnagrinėjus visas su byla susijusias aplinkybes.
Vilniaus apygardos administracininio teismo teisėjų kolegija, išnagrinėjusi bylą, priėjo išvadą, kad Valstybinės mokesčių inspekcijos 2008-06-27 ir Klaipėdos apskrities VMI 2008-05-20 sprendimai yra priimti pažeidžiant procesines teisės normas, todėl juos panaikino kaip nepagrįstus, o pareiškėjos skundą patenkino. Teismas pažymėjo, kad Klaipėdos apskrities VMI sprendimas buvo priimtas remiantis vietos mokesčių administratoriaus sudarytos laikinosios darbo grupės išvadomis ir AB „Laivitė“ pateiktų duomenų analize, t. y. tuo, ko nei Mokesčių administravimo įstatymas, nei kiti teisės aktai nenustato. Be to, sprendimas priimtas nedalyvaujant Konkurencijos tarybai - pagrindiniam valstybės pagalbą įmonėms kontroliuojančiam subjektui, nors Klaipėdos apskrities valstybinės mokesčių inspekcija savo 2003-03-17 sprendimą priėmė remdamasi būtent Konkurencijos tarybos 2003-02-12 nutarimu dėl valstybės pagalbos suteikimo „Laivitei“. Jokie teisės aktai vietos mokesčių administratoriui nesuteikia teisės naikinti savo priimtą sprendimą dėl atleidimo nuo delspinigių.