II etapo rungtynės turi būti sužaistos iki liepos 3 dienos.
2011–2012 m. LFF taurės II etapo poros:
23. Vilniaus „Polonia“ (II lyga, Pietų zona) – Vilniaus „Pietų IV“ (Sekmadienio futbolo lyga)
24. Kaišiadorių „Baltai“ (II, Pietų zona) – Vilniaus „Ozo tapyrai“ (SFL)
25. Vilniaus „Prelegentai“ (SFL) – Kauno „91 United“ (III, Kauno AFF)
26. Kauno „Fortas“ (III, Kauno AFF) – Radviliškio „Lokomotyvas“ (III, Šiaulių AFF)
27. Vilniaus „Ozas“ (SFL) – Klaipėdos „Jambo“ (SFL)
28. Vilniaus „FM-Granitas“ (II lyga, Pietų zona) – Alytaus „Centras“ (SFL)
29. Vilniaus „Fakyrai“ (SFL) – Kauno „Visas labas“ (III, Kauno AFF)
30. Vilniaus „Aktas“ (SFL) – Šiaulių „Fanai“ (III, Šiaulių AFF)
31. Rokiškio „Rokiškis“ (III, Utenos AFF) – Vilniaus „Peruno“ (SFL)
32. Vilniaus „Bekentas“ (II, Pietų zona) – Vilniaus „GB United“ (SFL)
33. Plikių „Sakuona“ (II lyga, Vakarų zona) – Pagėgių „Pagėgiai“ (SFL)
