Seimui siūloma sušvelninti reikalavimus pretendentams į muitinės vadovus atsisakant statutinės patirties – taip tikimasi sulaukti daugiau kandidatų į muitinės vadovus.
Seimas taip pat linkęs palikti draudimą Muitinės vadovui vienašališkai tvirtinti įstaigos struktūrą. Tai reiškia, kad jis toliau negalėtų nesuderinęs su finansų ministru spręsti dėl postų steigimo ar naikinimo.
Be kita ko, numatoma sujungti aštuonias teritorines ir specialiąsias muitines į vieną įstaigą. Finansų viceministras Lukas Jakubonis yra sakęs, kad jas sujungus darbuotojų nesumažės.
Lietuvos muitinės sistemą dabar sudaro departamentas, Muitinės kriminalinė tarnyba, Muitinės mokymo centras, Muitinės laboratorija, Muitinės informacinių sistemų centras ir trys teritorinės muitinės – Vilniaus, Kauno ir Klaipėdos.
Po reformos muitinės postuose atsisakoma pareigūnų rotacijos – Specialiųjų tyrimų tarnyba sako, kad dėl to gali didėti korupcijos rizika.
Projektu siūloma atsisakyti muitininkų (išskyrus postų vadovų ir jų pavaduotojų) darbo vietos periodinio keitimo – pareigūnai bus priskiriami prie konkretaus posto.
Pakeitimų aiškinamajame rašte nurodyta, kad įgyvendinus pertvarką planuojama sutaupyti iki 30 proc. institucijai skirtų lėšų.
Dabar departamente dirba apie 350 žmonių, rodo „Sodros“ duomenys.